生物学者の個人アカウントです。フォロー・返信等お気軽に。構造生物学/生化学/バイオインフォマティクス/プログラミングフォント(IncoUDJP,Ricty後継の開発)/遺伝子工学/環境学/空手/古武道(棒,半棒,ヌンチャク)
京都
Joined January 2012
- Tweets1.5K
- Following267
- Followers263
- Likes25.1K
Pinned Tweet
読みやすいプログラミングフォントIncoUDJP（インコ・ユニバーサルデザイン日本語プログラミングフォント）公開中！
Ricty DiminishedをJIS第4水準漢字まで拡張したShinDiminished（シン・ディミニッシュト）も公開中！
どちらもRictyと同じ文字幅です。
structure.kais.kyoto-u.ac.jp…
年収600万円という額が話題になっていますが、非正規の研究員の募集なのでやむを得ない額かと思います。
年収以前に1年契約（最長3年）の求人にアメリカから優秀な方が来るとは思えませんが。
そもそも発端のトランプ大統領によるハーバード大の予算凍結が無効化されましたし…。
年収600万円では米国に負ける、研究者100人招致狙うも採用1人 阪大
nikkei.com/article/DGXZQOSG2…
何故か知りませんが教育学部は入試が前期、後期になっていることが多いようです。
前期でどこか受かってると行きませんよね…。
コーディングをしています。ローカルのstrata(Qwen3.8-Flash-Next)+Deepseek HarnessのみでPutty日本語版（ranvis版）をMacへ移植しました。
⌘C/⌘Vでコピペ出来るように修正もしました。Homebrew版（英語版）はコピペが出来ないのです⋯。
structure.kais.kyoto-u.ac.jp…
Please wait a little longer for the fixes (such as copy-paste) and release of PuTTY for Mac (English version). I thought it should be merged into Homebrew, but it was rejected with instructions to handle it upstream, so I will publish it on my own.
SSHクライアントPutty日本語版をMacへ移植しました！
ローカルLLMだけで半日回してバイブコーディングを行いました。
⌘C/⌘Vでコピペ出来ます（Homebrew版はコピペが出来ないのです⋯）。
鍵作製用のPuTTYgenはインターフェースを新規に作製しました。
structure.kais.kyoto-u.ac.jp…
窒素原子を持つアミノ酸が肝臓で分解されて生じた有害なアンモニアは、尿素に無毒化されたあと、腎臓で濾過されて排泄されます。腎臓でも一部のアミノ酸の分解によるpH調整が行われます。タンパク質を摂りすぎると、腎臓での濾過や分解に過度な負荷がかかる可能性がありますね。
Strata+Deepseek HarnessでローカルAIでコーディングが十分できるようになりましたね。
うちもクラウドAIの契約を解約されたというのがきっかけです。
いくらでも使えるのでソフトの公開とかの交渉に時間を取られます…。
たぶんなんだけどこれ、4ヶ月前に、claudecode利用止めてなかったら発想に無かった気がする。だってclaude使ってれば地元LLM使う必要無いじゃんの気が強かったはず。
この評価を本格的に覆してきたのがqwen3.8-flash-nextとstrataで、決定づけたのがdeepseek hernes。
観測範囲では、hermes agentと違い、ちゃんとブラウザ操作にも最適化されててまともに操作できる初のハーネス。
tailescaleで自宅pcに繋ぎ、ブラウザから200GB級のダウンロードを途切れさせず約9時間監視させたり、メルカリにアクセスさせた内容の細かいチェック、見た画像はコレですのリンク貼り、いやいや、配慮が行き渡りすぎてる。作ってる側が明確に自分で使ってて、この機能欲しい、で盛り込みまくってるのが素晴らしい。なんなら、mdリーダーついてるからね、deepseek hernes。
書いてて思ったがローカルLLMの評価を変えた主軸は多分間違いなくdeepseek hernesだわ。これを皆入れてブラウザから利用してくれ。評価軸がまじで変わる。6段階位一気にハーネスのレベルジャンプ体感してる。今の所もうこれしか使う気が起きん。
RTX3090(24GB)+strata(Qwen3.8-Flash-Next コンテキスト長256K)+Deepseek Harnessで長時間作業が安定して出来ています。
DHSやPi-webは大きいファイルをgrepやpythonで処理して適切にモデルに渡してくれます。
Opencodeは前処理が甘くローカルLLMと相性が悪い印象です。
ローカルLLMの次の課題は、モデルを高速に動かすことから、大量のコンテキストを保持して長時間作業させることに移りつつあると感じています。
現在、RTX 5070 12GB＋RTX 5060 Ti 16GBのデュアルGPUで、Strataを使ってQwen3.8-Flash-Next IQ3_Sを運用しています。
生成速度は最大52.2 token/sと十分実用的ですが、OpenCodeで大規模なプログラムを開発させるには、128K程度のコンテキスト長を確保したいところです。
しかし、コンテキストが長くなるとKVキャッシュのメモリ消費も増えるため、VRAM合計28GBでは余裕がありません。
そこでRTX 5060 Ti 16GBをもう1枚追加し、合計44GBの3GPU構成を検討しています。
マザーボードはASRock X870 Taichi Creator。
CPU直結のPCIeスロット2基は既に使用しているため、空きM.2スロットからOCuLinkやPCIeライザーで3枚目を接続する計画です。
3GPUでの動作や128K対応はこれからの検証になりますが、既存のGPUを活かしながら段階的にVRAMを増やせるのは自作PCの大きなメリットです。
目指しているのは、完全ローカルで長時間自律的に開発を進められるAIコーディング環境です。
ローカルのstrata(Qwen3.8-Flash-Next)+Deepseek HarnessでPuttyのMacへの移植が出来てしまいました（近日公開します）。
アルトマン氏の焦りも分かります。
「今は個人PCに大量のメモリを使うべきでない」OpenAI CEOアルトマン氏が指摘 - PC Watch pc.watch.impress.co.jp/docs/…
SSHクライアントPutty日本語版をMacへ移植しました！
ローカルLLMだけで半日回してバイブコーディングを行いました。
⌘C/⌘Vでコピペ出来ます（Homebrew版はコピペが出来ないのです⋯）。
鍵作製用のPuTTYgenはインターフェースを新規に作製しました。
structure.kais.kyoto-u.ac.jp…
先斗町公園と鴨川河川敷をつなぐ社会実験が始まるそうです。
河川敷の西側にある水路（みそそぎ川）を跨ぎます。
過去に反対運動で常設の橋の計画が潰されたらしいですが橋があると便利そうですね。
現状は三条、四条の間では鴨川西岸から上がれないので災害時に心配です。
磁気テープ増産のニュースに驚きました。
大掃除で出てくることがある昔のDDSテープも、今や読むハードがありません…。
昔は週1位でワークステーションのバックアップを取っていたものです。
tar コマンドの「t」が Tape（Tape Archive）の略だと知らない人も多そうですね。
富士フイルム、磁気テープ20年ぶり大型増産 AIデータ保存リスク低く
nikkei.com/article/DGXZQOUC0…
ちなみに京都大学の教員は来年度から勤務時間の打刻が導入されます。
残業代が出るのかな、出ないだろうな。
京都大学教職員
スケジュールをGaroonからGoogleカレンダーへ移行
「（教職員グループウェア）スケジュール機能（個人予定および施設予約）のGoogleカレンダーへの一本化に向けた事前準備のお願い」
iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/news/i…
おおつ花フェスタが琵琶湖岸のサンシャインビーチで開催中です。
多肉屋さんがすごく増えましたがもう研究をやめて増やしたくないので買えません…。
ハーブ類を見たかったのですがほとんどないですね。
和風の薬草屋さんはありました。
どくだみ茶を試飲させてもらいました。
