@SatoshiTodaLab

Trying to synthesize cell funstions by design. Synthetic biology@Institute for Protein Research, Osaka University

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Joined August 2023
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I'm excited to share our new paper on synthetic pattern formation led by @Kosuke_Mizu and collaborator @hirashima0203 ! embopress.org/doi/full/10.10…. We have developed 3D culture system called SYMPLE3D to explore how signaling proteins generate precise tissue patterns.
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I'm excited to share our new collaborative paper on structural dynamics of Afamin and Afamin/Wnt3a complex revealed by high-speed atomic force microscopy (HS-AFM), led by Hikaru and Kosuke @Kosuke_Mizu. pubs.acs.org/doi/10.1021/acs… nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/en/…

Structural Dynamics of the Afamin/Wnt3a Complex Mediated by the Afamin Hydrophobic Pocket

Abstract. Afamin is a serum glycoprotein that stabilizes and transports hydrophobic signaling protein Wnt3a, but the structural basis of this function has

pubs.acs.org
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This work is a collaboration with Dr. Noriyuki Kodera and Dr. Holger Flechsig @nanolsi. It's exciting to observe the nanoscale dynamics of Afamin/Wnt3a complex and imagine how the complex behave to transmit Wnt signaling. Fantastic work by Hikaru and Kosuke!
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_MizuApr 15
NanoLSI古寺研、Flechsig研との共同研究論文が公開されました！Afamin, Afamin/Wnt3aの一分子観察に成功し、脂溶性ポケットの重要性を明らかにしました。当時修士の市田君（古寺研）と学生二人で主体的に始めた研究が形となり感慨深いです。市田君の凄まじい努力のお陰です。pubs.acs.org/doi/10.1021/acs…

Structural Dynamics of the Afamin/Wnt3a Complex Mediated by the Afamin Hydrophobic Pocket

Abstract. Afamin is a serum glycoprotein that stabilizes and transports hydrophobic signaling protein Wnt3a, but the structural basis of this function has

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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_MizuApr 15
Excited to share our collaborative work with the Kodera and Flechsig groups @nanolsi! We successfully visualized Afamin and the Afamin/Wnt3a complex using HS-AFM, revealing the critical role of the hydrophobic pocket of Afamin. Ichida-kun did amazing work! pubs.acs.org/doi/10.1021/acs…

Structural Dynamics of the Afamin/Wnt3a Complex Mediated by the Afamin Hydrophobic Pocket

Abstract. Afamin is a serum glycoprotein that stabilizes and transports hydrophobic signaling protein Wnt3a, but the structural basis of this function has

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Kosuke @Kosuke_Mizu won the Best Oral Presentation Award in the 23rd IPR retreat at Osaka Univ! He won the award again this year! Congrats!!
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_Mizu14 Jul 2025
細胞生物学会・発生生物学会合同大会でのワークショップ 「多細胞構造の設計図」 、いよいよ今週の金曜日です！ 私は、細胞死×パターン形成に関する研究内容を初出しします！ 是非たくさんの方々にご参加いただきたいです！
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_Mizu18 Jun 2025
拡散希望！ 7月18日(金)、名古屋で開催される細胞生物学会・発生生物学会合同大会にてワークショップ 「多細胞の設計図」 を平野咲雪さん @SayukiHirano と共にオーガナイズします。 バラエティー豊かな若手研究者が多細胞構造に関する最先端の知見を熱くご紹介します！ ぜひご参加ください！
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_Mizu18 Jun 2025
Please share! Join us for our workshop titled "Multicellular Blueprint" at the Joint Annual Meeting of JSDB and JSCB on July 18! A fantastic lineup of speakers working with diverse model systems will share their latest insights into multicellular systems.
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_Mizu7 Apr 2025
貴重な機会を頂きました！ どういった内容をお話するのかまだわかりませんが、楽しく頑張ります！
細胞生物若手の会@YMCB_KANSAI7 Apr 2025
＼細胞生物・発生生物若手 合同開催／ 📣 若手の会交流会のお知らせ ✨️ 日本細胞生物学会・日本発生生物学会合同大会に合わせまして、若手の会も合同交流会の開催が大会前日の7/15(火)に決定しました‼️ 未来の細胞生物・発生研究や自分の将来について考えながら、研究者仲間を見つけましょう💪🔬
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実験医学4月号「多細胞の合成生物学」が発行されました！このような特集の機会をいただいた実験医学さん、記事を執筆いただいた皆様に大変感謝です。細胞集団のふるまいをデザインする研究例の紹介に加えて、今後重要になってくる技術や進化の観点も取り入れた幅広いトピックの特集になっています。
羊土社 実験医学
@Yodosha_EM19 Mar 2025
【本日発行！】実験医学4月号 ●特集1：多細胞の合成生物学 　発生・分化機構を知って、創って、利用する （戸田　聡／編） いかにして生体組織は自律的に組み上がるのか？ 細胞集団のふるまいをデザインし，自己組織化の謎と人工組織の創出に挑む yodosha.co.jp/jikkenigaku/bo… （ツリーに続きます）

実験医学：特集1：多細胞の合成生物学　発生・分化機構を知って、創って、利用する／特集2：まずはCondaではじめよう　仮想環境で試せるバイオインフォマティクス

特集1：いかにして生体組織は自律的に組み上がるのか？ 細胞集団のふるまい・機能を自在にデザインし，自己組織化の謎と人工組織の創出に挑む／特集2：管理者権限がなくても大丈夫．共通計算機でも新たな解析ツールを気軽に試せる方法を手取り足取り伝授します．

yodosha.co.jp
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_Mizu19 Mar 2025
「多細胞の合成生物学」が特集された実験医学@Yodosha_EM が発行されました！ 戸田先生@SatoshiTodaLabが編者を務め、私も執筆者の一人として参加させて頂きました。昨年発表した論文embopress.org/doi/full/10.10…の内容をもとに、ユニークな手法を活用した多細胞構造の理解について解説しています。
羊土社 実験医学
@Yodosha_EM19 Mar 2025
【本日発行！】実験医学4月号 ●特集1：多細胞の合成生物学 　発生・分化機構を知って、創って、利用する （戸田　聡／編） いかにして生体組織は自律的に組み上がるのか？ 細胞集団のふるまいをデザインし，自己組織化の謎と人工組織の創出に挑む yodosha.co.jp/jikkenigaku/bo… （ツリーに続きます）

実験医学：特集1：多細胞の合成生物学　発生・分化機構を知って、創って、利用する／特集2：まずはCondaではじめよう　仮想環境で試せるバイオインフォマティクス

特集1：いかにして生体組織は自律的に組み上がるのか？ 細胞集団のふるまい・機能を自在にデザインし，自己組織化の謎と人工組織の創出に挑む／特集2：管理者権限がなくても大丈夫．共通計算機でも新たな解析ツールを気軽に試せる方法を手取り足取り伝授します．

yodosha.co.jp
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Aki Teranishi@aki_teranishi12 Dec 2024
I'm very excited to share our new work in @NatureComms from @MechgenLab! We reported an elastoplastic property of epithelia that determines the irreversibility of folding and is regulated in a mechanosensitive manner. nature.com/articles/s41467-0…

An actin bracket-induced elastoplastic transition determines epithelial folding irreversibility

Nature Communications - During morphogenesis, epithelial folding is irreversible, ensuring that the process proceeds in one direction. Here, the authors report that, given sufficient curvature or...

nature.com
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
Okuda Lab@MechgenLab13 Dec 2024
A new paper, 'An actin bracket-induced elastoplastic transition determines epithelial folding irreversibility,' has been published in @NatureComms. Led by @aki_teranishi, the team includes Satoshi Toda (Osaka Univ) and Go Shioi (RIKEN). Reposting after accidentally deleting the original tweet... nature.com/articles/s41467-0…
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Tsuyoshi Hirashima@hirashima02032 Dec 2024
Ran into @SatoshiTodaLab and we were twinning with the same shirts! No wonder our recent collab was a perfect fit! xitter.cf/SatoshiTodaLab/status/…
Satoshi Toda/戸田 聡@SatoshiTodaLab27 Sep 2024
I'm excited to share our new paper on synthetic pattern formation led by @Kosuke_Mizu and collaborator @hirashima0203 ! embopress.org/doi/full/10.10…. We have developed 3D culture system called SYMPLE3D to explore how signaling proteins generate precise tissue patterns.
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Kosuke @Kosuke_Mizu won the Best Oral Presentation Award in the 22nd IPR retreat at Osaka Univ!! Congrats!!
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
大阪大学蛋白質研究所@IPR_pr2 Oct 2024
【プレスリリース】戸田聡准教授らの共同研究の研究成果が科学雑誌『EMBO Reports』にオンライン掲載されました。 protein.osaka-u.ac.jp/achiev… embopress.org/doi/full/10.10… #蛋白質研究所 #大阪大学 #プレスリリース #合成生物学 #シグナル伝達 #morphogens #tissue_patterning #cell_adhesion
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Satoshi Toda/戸田 聡 retweeted
WPI-NanoLSI@nanolsi2 Oct 2024
WPI-NanoLSI and NUS's joint research group's paper was recently published in EMBO Reports‼️ @IPR_pr @SatoshiTodaLab @hirashima0203 @Kosuke_Mizu Robust tissue pattern formation by coupling morphogen signal and cell adhesion | EMBO reports embopress.org/doi/full/10.10…

Robust tissue pattern formation by coupling morphogen signal and cell adhesion

EMBO Reports - Morphogens, locally produced signaling molecules, form a concentration gradient to guide tissue patterning. Tissue patterns emerge as a collaboration between morphogen diffusion and...

link.springer.com
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Nice movie showing the cooperation of morphogen gradient and cell adhesion-based sorting posted by @Kosuke_Mizu . Congrats!
Kosuke Mizuno/水野 皓介@Kosuke_Mizu27 Sep 2024
Excited to share our new study in @EMBOreports from @SatoshiTodaLab with Tsuyoshi Hirashima (@hirashima0203)! We showed how morphogen and cell adhesion create robust tissue domains with a sharp boundary using our original model system, SYMPLE3D. embopress.org/doi/full/10.10…
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Just starting X to share my lab news! We are taking synthetic biology approaches to understand and control tissue development processes.
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