虫好きで鉄道好き（三歳児か）。ハサミとピンセットで魚をさばいていたが、キーボードとマウスに変わった「両生類」（今の本業は微生物のデータベース）。個人的に遺伝子（配列）と博物館標本（モノ）の両方にも足をつっこんでいるんですが（Museomics）、これまた両生類でしょうか。古本屋に出没。英語アカウントは@tkr_nak
Tokyo, Japan
Joined March 2008
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微生物データベースを読み解く
doi.org/10.34565/seibutsukog…
著者の @chalkless さんにご紹介いただきました！
NCBI TaxonomyとGTDBの比較など最近の微生物データベース界隈の状況がよくまとめられていて勉強になりました！
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Proud to share our new Nature Microbiology paper: launching the IUCN Microbial Conservation Specialist Group!
Microbes = the planet’s hidden life support system
Now, they finally have a seat at the conservation table.
Read here ➡️ rdcu.be/eFOE3
#MicrobialConservation
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科博からのプレスリリース記事が公開になりました。
「あえて「臭く」進化した花たちのニオイを生み出す仕組みを解明-虫を呼ぶために複数の植物で収斂進化していた！」
実は気合が入りすぎてPRタイムズの字数制限を超えてしまい、やむなく用語解説を一部削っています。
prtimes.jp/main/html/rd/p/00…
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JT生命誌研究館の尾崎さんをお迎えし、研究の最前線についてお話していただきます。
講演会「チョウが食草を見分けるしくみを探る」【3月9日】
JT生命誌研究館の尾崎さんをお迎えし、研究の最前線についてお話していただきます。itakon.com/news/%e8%ac%9b%e6…
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【お知らせ】2025年2月20日(木) 14時〜於：一橋講堂
ABS国際シンポジウムとしてGBIF事務局長のJoe Miller博士をお招きして
「地球規模生物多様性情報機構（GBIF）と日本の遺伝資源情報」 を開催いたします！お申し込みは下記サイトより。
idenshigen.jp/2025/01/24/202…
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『改訂 独習Pythonバイオ情報解析』が本日発行🎉
データの取り扱いや可視化など，汎用的なPythonの使い方から，シングルセル，RNA-seq解析までバイオインフォの基礎が身につく入門書💻
改訂では，Scanpyの詳しい解説，生成AI活用のコツなど今知りたいテーマも追加😀
yodosha.co.jp/jikkenigaku/bo…
ALT 付属のサンプルデータとコード見本があるからすぐに始められる！コードの動きを手元で確認しながら、実践的に理解できる。
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現在挑戦中のクラウドファンディングについて、朝日新聞さんが紹介記事を書いて下さいました！クワガタ研究は、昆虫飼育環境が抜群に優れている日本だからこそ出来る研究でもあります。
クワガタはなぜかっこいい「日本ならでは」の研究に挑むクラファン：朝日新聞デジタル asahi.com/articles/AST1H1RKS…
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クワガタムシ研究でクラファン挑戦中です！皆様のご支援と応援のお陰で35％まで来ました！引き続きご支援をよろしくお願いいたします！残り43日！
academist-cf.com/projects/36…
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本日よりクラウドファンディングに挑戦します！
研究レポートの送付やオンライントークへの招待、研究室見学会の開催など、クワガタ研究のワクワク感を共有できる支援リターンを準備しました。クワガタ研究を盛り上げるため、皆様のご支援をいただけましたら嬉しいです！
academist-cf.com/projects/36…
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A blog from me today on the background to the @globalbiodata Open Letter. Add your voice in support of the world's essential life science data infrastructure #biodatacounts.
Today is an important day for the future of global biodata resources. GBC Executive Director, @guyrcochrane writes about the significance of the Open Letter campaign in raising awareness of the issue of biodata sustainability.
Click here to read blog bit.ly/4fu51eG
#biodatacounts
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「国立国会図書館デジタルコレクション」を含む各種サービス、システムメンテで2024年12月27日（金）18時～2025年1月6日（月）の間使えなくなるらしいので、年末年始にバリバリ仕事しようとしていた人とか、学位論文追い込みの人たち、気を付けてくださいね……（今知った）
ndl.go.jp/jp/news/maintenanc…
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📣 Calling data deep-divers, 🦋 policy powerhouses ✍️ & clever coders! 📊
The #BiodiversityHackathon hosted by @WorldBank kicks off 15 October 9:00 EDT!
Join GBIF @NASA @theGEF @OBISNetwork @GEOBON_org @esa & more in this 🌎biodiversity initiative!
🔗 | buff.ly/4eXfhLX
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BREAKING NEWS
The Royal Swedish Academy of Sciences has decided to award the 2024 #NobelPrize in Chemistry with one half to David Baker “for computational protein design” and the other half jointly to Demis Hassabis and John M. Jumper “for protein structure prediction.”
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SPNHC-TDWG2024合同大会 日本初開催！沖縄発のサステナブルMICE運営へチャレンジします！ prtimes.jp/main/html/rd/p/00…
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自然史博物館をつくる会を設立 県内生物標本の危機で有志「必要性発信を明確に」 kochinews.co.jp/article/deta… 高知県内で収集された生物標本が保管場所の不足や持ち主の高齢化などにより散逸の危機にある問題で、県内の専門家らがこのほど、「高知に自然史博物館をつくる会」（谷地森秀二代表＝横倉山…
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Illumina はSPAdesで、NanoporeはCANUでアセンブリする。ハイブリッドアセンブリは複雑な群集構造のメタゲノムにはあまり効果的ではなさそう。
microbiologyresearch.org/con…
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(6/19-) DDBJ SearchのURL構造が変わります
ddbj.nig.ac.jp/news/ja/2024-…