@okapik

Associate professor at Institute for Molecular Science and Research Center for Computational Science

 愛知 岡崎市
Joined December 2009
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大貫さんのAlphaFold3におけるタンパク質の構造サンプリング促進に関する論文が、JACS Au @ACSPublications に出版されました。拡散モデルによる構造生成過程に、物理的ポテンシャルを導入して予測構造の多様性を向上させるアプローチです。pubs.acs.org/jaaucr/article/…

Enhanced Sampling of Protein Conformations in AlphaFold3 with Repulsive Bias in the Diffusion...

Abstract. Conformational changes in proteins are vital to their function yet remain challenging for state-of-the-art artificial intelligence, such as Alpha

pubs.acs.org
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Harry Kane
@HKane13h
Work hard in silence. Let success be your noise. 🏆
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Frank Noe@FrankNoeBerlinOct 20
Public preview of BioEmu2! @MSFTResearch AI for Science’s new foundation model for biomolecular structure, dynamics and function. Open weights, MIT license. github.com/microsoft/bioemu2 Movie: BioEmu2-simulated binding of intrinsically disordered peptide PUMA to MCL-1 receptor. 🧵⬇️
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【注目プレスリリース】薬の副作用の影響を排除し、標的タンパク質の機能解析を可能にする新技術を開発 ～GPCRを標的としたより安全で効果的な疾患治療法の創出に期待～ / 名古屋大学,東京科学大学,筑波大学,日本医療研究開発機構 research-er.jp/articles/view…

【プレスリリース】薬の副作用の影響を排除し、標的タンパク質の機能解析を可能にする新技術を開発 ～GPCRを標的としたより安全で効果的な疾患治療法の創出に期待～ | 日本の研究.com

2026.10.05 名古屋大学,東京科学大学,筑波大学,日本医療研究開発機構 プレスリリース 【本研究のポイント】薬剤の副作用(オフターゲット効果 注 1) )の影響を最小限にし、標的とするタンパク質の機能を正確に明らかにする新技術「ESCAPE 法」を開発。全医薬品の約 3 割が標的とする重要な...

research-er.jp
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【公募】京都大学 理学研究科 生物科学専攻（生物物理学系）　 テニュアトラック助教(細胞内生命現象に関わる理論生物物理学的研究；締切2026年11月13日) jrecin.jst.go.jp/seek/SeekJo…

JREC-IN | 京都大学 理学研究科 生物科学専攻（生物物理学系）　助教の公募

イノベーション創出を担う研究人材のためのキャリア支援ポータルサイト

jrecin.jst.go.jp
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J-STAGE Articles - 光遺伝学とノーベル賞 doi.org/10.2142/biophys.66.1…

光遺伝学とノーベル賞

生物物理, 2026 年 66 巻 3 号 p. 172-173

jstage.jst.go.jp
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浜名湖で船釣りをしました。色々連れて楽しかったです。 #古橋屋
ゆうでん@FURUHASHIYASep 26
9/26 小物釣り。親子4人で釣行。キス、セイゴ、エソ、ヘダイ、ヒイラギ、フグと五目釣り。終盤釣った魚に点数つけて競うなど楽しんでいただけて何より。 #古橋屋 #ボートフィシング #釣り船頭 #浜名湖
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バーベキューで食べました🍖
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Sergey Ovchinnikov@sokryptonSep 24
Replying to @compchemm
I find it helpful is to only show the de-noised frames at each step instead of after adding noise. One step is all you need to predict the protein part and the rest of the steps are just fixing sidechains/ligand. Showing the noised steps gives a false illusion of global sampling.
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今からスイス🇨🇭行き〜元ボスの還暦祝い研究会で、懐かしい人々に会えたらいいな
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中日新聞
@chunichi_denhenSep 8
名古屋・栄駅の4番出入り口周辺の様子が届きました。
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タンパク質構造予測AIの限界を突破し、構造変化の予測へ〜ノーベル化学賞のAI技術AlphaFoldの問題点を解決〜（岡崎グループ） ims.ac.jp/news/2026/09/0901.…
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論文のリンク：pubs.acs.org/jaaucr/article/…

Enhanced Sampling of Protein Conformations in AlphaFold3 with Repulsive Bias in the Diffusion...

Abstract. Conformational changes in proteins are vital to their function yet remain challenging for state-of-the-art artificial intelligence, such as Alpha

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【プレスリリース】タンパク質構造予測AIの限界を突破し、構造変化の予測へ〜ノーベル化学賞のAI技術AlphaFoldの問題点を解決〜 ■詳細はこちらをご覧ください。 soken.ac.jp/news/2026/202609…
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Our paper on enhanced sampling of protein conformations in AlphaFold3 was published in JACS Au @ACSPublications ! Please check the link: pubs.acs.org/jaaucr/article/…

Enhanced Sampling of Protein Conformations in AlphaFold3 with Repulsive Bias in the Diffusion...

Abstract. Conformational changes in proteins are vital to their function yet remain challenging for state-of-the-art artificial intelligence, such as Alpha

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【あいみょん】ゴッホの生涯〜カノン進行名曲メドレーにのせて〜【X JAPAN】 youtu.be/Zr5YQeHe7PU?si=-PzX… @YouTubeより

【あいみょん】ゴッホの生涯〜カノン進行名曲メドレーにのせて〜【X JAPAN】

五郎、解放ー。皆さん登録者1000人突破ありがとうございます‼️㊗️感謝の気持ちを込めて、五郎さんにギターで弾き語りをしていた...

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皆様へ 作家・東野圭吾さんが、7月23日未明、逝去されました。 ここに、謹んで哀悼の意を表し、お知らせ申し上げます。 東野圭吾さんのご著書は1985年9月刊行のデビュー作『放課後』から、 2026年8月5日刊行予定の最新刊『永遠の記憶』を含めて 106冊（共著をのぞく）を数えます。 生み出された物語はたくさんの読者を魅了し続けることと思います。 これからも、東野さんの小説をお楽しみください。
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藤崎さん@hiro2fuji 、松永さんら訳の「タンパク質の動きと機能」をご献本いただきました。タンパク質科学や生物物理の理論計算よりの本で、とても面白そうです。
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かつー@BS垢もsgjk
@SGJKJul 14
「フランスにどう勝つんだよ…」という世界中の絶望に「普通にやるだけだが？」で応えてみせるスペイン凄すぎ。 初戦とは言え引き分けたカーボベルデの評価がまた上がるわ
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ヨッピー
@yoppymodel29 Mar 2024
公開されたーーーよーーー！ ぜひ読んでください！！！！！ 「ワイ、戦国武将・長宗我部元親（ちょうそかべもとちか）の末裔説」を本気で検証してみた。佐賀の『はじまりの名護屋城。』をきっかけに遠い先祖（？）へ思いを馳せる news.denfaminicogamer.jp/kik…
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