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BLAST作ったりDESeq2作ったりAlphaFold作ったりEvo2作ったりする人がバイオインフォマティシャンだと５億年前から言ってる
ひよこ🐣 (@bio_labcode) profile pictureひよこ🐣@bio_labcodeNov 8
AI時代のバイオインフォマティシャンの生き残り戦略知りたい。だってもうみんなsalmonとかDEseq2とか意識してなくて、もうAIで直接エンリッチメント解析とかボルケーノプロットまで出してもらってるでしょ？MLの予測精度の改善とかloop回して自動化してるでしょ？
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今後はバイオインフォマティシャンに求められるのは環境構築力だと思ってる。馬鹿みたいにウェットデータを取って、解析はAWS上とかでブラウザサービスレベルまで仕上げて(ITわからない人が回せるレベル)、ガンガン回す。解析に意味を持たせたり細かい調整とか法規制対応はまだ専門家が必要
ひよこ🐣 (@bio_labcode) profile pictureひよこ🐣@bio_labcodeNov 8
AI時代のバイオインフォマティシャンの生き残り戦略知りたい。だってもうみんなsalmonとかDEseq2とか意識してなくて、もうAIで直接エンリッチメント解析とかボルケーノプロットまで出してもらってるでしょ？MLの予測精度の改善とかloop回して自動化してるでしょ？
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先週のわたし(20261101-20261107) blog.kzfmix.com/entry/179418…
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ハノイ四日目 blog.kzfmix.com/entry/179396…
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なかなか楽しい旅であった
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ハノイ三日目 blog.kzfmix.com/entry/179395…
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ハノイ二日目 blog.kzfmix.com/entry/179388…
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PyMOLish（パイモリッシュ?） Extra commands for PyMOL Open Source that take the repetitive scripting out of everyday structure work. github.com/adrian-jasinski/p…
🤖 Made with AI
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一昨日二周した
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ビールを飲みながら交差点に座って道ゆく人々を観察するおじさんと化した。
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ホテル移ってみたのだけどチェクインタイムを1時間過ぎてもまだ部屋の準備が出来ていないということで仕方なく飲みに出た
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ホテルのネット回線弱弱でeSIM使っているのだけど、初めてギガがないという状況に直面した。
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Nakata, M., & Maeda, T. (2026). PubChemQC wB97X-D/def2-SVPD//wB97X-D/def2-SVP dataset, release 1.0.0: per-molecule CSV tables (Version 1.0.0) [Dataset]. Zenodo. doi.org/10.5281/zenodo.23749… #compchem #ml #quantumchem 世界最大級量子化学計算されたデータセット公開しました1100万分子です!!

PubChemQC wB97X-D/def2-SVPD//wB97X-D/def2-SVP dataset, release 1.0.0: per-molecule CSV tables

CSV tables of a quantum chemical dataset of 11,398,933 neutral, closed-shell molecules from PubChem (downloaded on 6 November 2020), with one row per molecule. Calculations: Conformer search with...

zenodo.org
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Mike Posner - I Took A Pill In Ibiza (Wizzal Remix) youtu.be/aKnxmRhW8gM?is=OgGe… via @YouTube
Mike Posner - I Took A Pill In Ibiza (Wizzal Remix)

Mike Posner - I Took A Pill In Ibiza (Wizzal Remix)

DeepHouse / Car Music / Chill Music🎧 Spotify Playlist:https://op...

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広い部屋だけ取っておけば、遠出しなくてもそこらへん歩いてるだけで楽しいのでハノイは良い。道がわちゃわちゃし過ぎて車移動したくないというのもあるが。
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クラフトビールうまし
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ハノイ一日目 blog.kzfmix.com/entry/179375…
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2026年11月発行のMEDCHEM NEWSに、低分子化合物の構造生成AIを中心とするEssayを寄稿しました。現所属の小ネタも載せていますので、IDをお持ちの方はご一読いただけると。 jstage.jst.go.jp/article/med…
Rethinking Drug Discovery ─メディシナルケミストとAIの協働が拓く創薬の未来

Rethinking Drug Discovery ─メディシナルケミストとAIの協働が拓く創薬の未来

AI技術の進展により、予測モデルや構造生成AIは創薬研究へ急速に広がっている。一方、AIの専門知識をもたないメディシナルケミストが、日常の探索研究でAIを有効に活用する方法は、なお確立途上にある。本稿では、多国籍・異分野の人材が協働するElixの組織文化と、現場のメディシナルケミストを中心としたAI …

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「命の砂時計が消費されてしまう」というパワーワードを社内会議で使ってみたい衝動に駆られている。
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